MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Tremblaya phenacola PAVE plasmid

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021553	AAC	2	6	31	36	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514064964
2	NC_021553	GAA	2	6	58	63	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514064964
3	NC_021553	CCAACA	2	12	104	115	50 %	0 %	0 %	50 %	514064964
4	NC_021553	GTT	2	6	134	139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514064964
5	NC_021553	ATG	2	6	155	160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514064964
6	NC_021553	TGT	2	6	235	240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514064964
7	NC_021553	TCT	2	6	252	257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514064964
8	NC_021553	CCCT	2	8	325	332	0 %	25 %	0 %	75 %	514064965
9	NC_021553	TCT	2	6	333	338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514064965
10	NC_021553	TTC	2	6	343	348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514064965
11	NC_021553	CTT	2	6	349	354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514064965
12	NC_021553	ACC	2	6	367	372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	514064965
13	NC_021553	ACA	2	6	406	411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514064965
14	NC_021553	GTT	2	6	442	447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514064965
15	NC_021553	AGAA	2	8	460	467	75 %	0 %	25 %	0 %	514064965
16	NC_021553	AAG	2	6	468	473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514064965
17	NC_021553	TGT	2	6	494	499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514064965
18	NC_021553	TCC	2	6	533	538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	514064965
19	NC_021553	AAT	2	6	625	630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514064965
20	NC_021553	TTTTG	2	10	678	687	0 %	80 %	20 %	0 %	514064965
21	NC_021553	TGT	2	6	720	725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021553	GAA	2	6	728	733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.